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LimnoMar wurde im September 1991 von Dr. B. T. Watermann als unabhängiges, privates Labor für limnische und marine Forschung in Hamburg gegründet. Eine zweite Niederlassung unter der Leitung von B. Daehne befindet sich seit 2002 auf Norderney. Dort verfügt LimnoMar über eigene Bewuchsstationen im Hafen und am Strand.
Schwerpunkte von LimnoMar sind die Fachgebiete Bewuchs und Bewuchsschutzsysteme (Fouling/Antifouling) sowie Auswirkungen von Schadstoffen auf marine oder aquatische Lebewesen (Pathologie/Toxikologie).

LimnoMar verfügt über ein Team qualifizierter Biologen, Geographen und technischer AssistentInnen. Für spezifische Fragestellungen werden Teams mit externen Fachleuten anderer Disziplinen gebildet.